แม้ว่าภาพรวมด้านสุขภาพของคอร์กี้อยู่ในระดับที่ดี แต่เจ้าของน้องหมาสายพันธุ์นี้ก็ต้องระมัดระวังเรื่องโรคต่าง ๆ ที่มักเกิดขึ้นกับสายพันธุ์คอร์กี้เอาไว้ก่อน โดยโรคที่อาจพบได้ในสุนัขสายพันธุ์คอร์กี้ ได้แก่
- โรคอ้วน และภาวะน้ำหนักเกิน : น้องหมาสายพันธุ์คอร์กี้มีแนวโน้มที่จะอ้วนได้ง่าย และมีนิสัยรักการกิน เจ้าของจึงควรพาสุนัขไปออกกำลังกายเป็นประจำ และเลือกอาหารที่เหมาะสมกับการใช้ชีวิตของคอร์กี้เพื่อให้ได้รับระดับพลังงานที่เหมาะสม
- ปัญหากระดูก และข้อต่อ : โดยโรคที่พบได้ในคอร์กี้เกี่ยวกับปัญหากระดูกและข้อต่อที่มีรายงานจาก Orthopedic Foundation for Animals (OFA) ได้แก่ ภาวะข้อสะโพกเสื่อม, ข้อศอกเสื่อม สำหรับภาวะข้อสะโพกเสื่อมนั้นเป็นปัญหาที่ถ่ายทอดได้ผ่านทางพันธุกรรม โดยสุนัขมักแสดงอาการเจ็บขาหลังเวลาเดินหรือลุกยืน
- โรควอนวิลลิแบรนด์ (von Willebrand disease) หรือ โรคเลือดออกง่าย เป็นโรคที่พบได้ทั้งในสุนัขและในคน โดยเป็นภาวะที่เป็นปัญหาเกี่ยวกับกระบวนการแข็งตัวของเลือด ส่งผลให้เกิดอาการ เช่น เลือดกำเดาไหล เลือดออกตามไรฟัน กรณีที่ทำการผ่าตัดจะทำให้เลือดหยุดยาก หรือพบปัญหาเลือดออกยาวนานเวลาเป็นสัดในสุนัขเพศเมีย อาจพบเลือดออกปนมากับอุจจาระได้ด้วยเช่นกัน โดยปกติการวินิจฉัยจะทำในช่วงที่สุนัขมีอายุระหว่าง 3-5 ปี แม้ภาวะนี้จะไม่สามารถรักษาให้หายขาดได้ แต่ก็สามารถจัดการได้ โดยปรึกษาแผนการดูแลน้องหมาร่วมกับสัตวแพทย์
- โรคต้อกระจก : สุนัขที่มีภาวะนี้จะพบว่าเลนส์ตามีความขุ่นขึ้น ทำให้มองเห็นได้ไม่ชัดเจน มักพบปัญหานี้ในสุนัขสูงวัย สามารถทำการรักษาได้ในบางราย โดยโดยผ่าตัดต้อกระจกเพื่อให้สภาวะการมองเห็นของสุนัขดีขึ้น
- โรคหัวใจ : สุนัขสายพันธุ์คอร์กี้อาจพบปัญหาเกี่ยวกับหัวใจ เช่น โรคหัวใจพิการแต่กำเนิดร่วมกับภาวะความดันหลอดเลือดปอดสูง ทำให้เกิดปัญหาเกี่ยวกับการนำส่งออกซิเจน ซึ่งสามารถวินิจฉัยได้แม้สุนัขจะยังอายุน้อยอยู่ก็ตาม และทำการรักษาได้ด้วยการผ่าตัด
- ภาวะลมชัก : เป็นโรคที่เกี่ยวกับระบบประสาทที่พบได้ในสุนัขสายพันธุ์นี้ โดยอาจพบว่าสุนัขเป็นลมล้มลงไป ขาเหยียดเกร็ง และหมดสติได้ หากพบปัญหาดังกล่าวควรพาสุนัขไปพบสัตวแพทย์เพื่อรับการรักษาอย่างเหมาะสม